Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms