Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Lcn6A2AJB9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Lcn6A2AJB9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Lcn6A2AJB9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Lcn6A2AJB9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Lcn6A2AJB9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Lcn6A2AJB9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Lcn6A2AJB9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Lcn6A2AJB9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lcn6A2AJB9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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