Protein–RNA interactions for Protein: A2A9C3

Szt2, KICSTOR complex protein SZT2, mousemouse

Predictions only

Length 3,431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szt2A2A9C3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Szt2A2A9C3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Szt2A2A9C3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Szt2A2A9C3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Szt2A2A9C3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Szt2A2A9C3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Szt2A2A9C3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Szt2A2A9C3 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Szt2A2A9C3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Szt2A2A9C3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Szt2A2A9C3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Szt2A2A9C3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Szt2A2A9C3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Szt2A2A9C3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Szt2A2A9C3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Szt2A2A9C3 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Szt2A2A9C3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Szt2A2A9C3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Szt2A2A9C3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Szt2A2A9C3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Szt2A2A9C3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Szt2A2A9C3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Szt2A2A9C3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms