Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prdm16A2A935 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prdm16A2A935 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms