Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Pramef6A2A8M8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms