Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms