Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Prdm2A2A7B5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms