Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms