Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YUM1

Gm7682, Predicted gene 7682, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7682A0A0J9YUM1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm7682A0A0J9YUM1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms