Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTW6

Scn2a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 2,006 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2aA0A0J9YTW6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Scn2aA0A0J9YTW6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Scn2aA0A0J9YTW6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Scn2aA0A0J9YTW6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Scn2aA0A0J9YTW6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Scn2aA0A0J9YTW6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Scn2aA0A0J9YTW6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Scn2aA0A0J9YTW6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Scn2aA0A0J9YTW6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Scn2aA0A0J9YTW6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Scn2aA0A0J9YTW6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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