Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YX06

Trbv21, T cell receptor beta, variable 21 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv21A0A0A6YX06 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms