Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ89

2210011C24Rik, MCG5930, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2210011C24RikA0A087WQ89 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2210011C24RikA0A087WQ89 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms