Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgb6Q9Z0T9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgb6Q9Z0T9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgb6Q9Z0T9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgb6Q9Z0T9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgb6Q9Z0T9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgb6Q9Z0T9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgb6Q9Z0T9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgb6Q9Z0T9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Itgb6Q9Z0T9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgb6Q9Z0T9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgb6Q9Z0T9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgb6Q9Z0T9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgb6Q9Z0T9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgb6Q9Z0T9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgb6Q9Z0T9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgb6Q9Z0T9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb6Q9Z0T9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb6Q9Z0T9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb6Q9Z0T9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgb6Q9Z0T9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgb6Q9Z0T9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgb6Q9Z0T9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgb6Q9Z0T9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgb6Q9Z0T9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgb6Q9Z0T9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgb6Q9Z0T9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgb6Q9Z0T9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgb6Q9Z0T9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgb6Q9Z0T9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb6Q9Z0T9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb6Q9Z0T9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb6Q9Z0T9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb6Q9Z0T9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb6Q9Z0T9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb6Q9Z0T9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Itgb6Q9Z0T9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb6Q9Z0T9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb6Q9Z0T9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb6Q9Z0T9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb6Q9Z0T9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb6Q9Z0T9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb6Q9Z0T9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb6Q9Z0T9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb6Q9Z0T9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgb6Q9Z0T9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgb6Q9Z0T9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb6Q9Z0T9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgb6Q9Z0T9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgb6Q9Z0T9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itgb6Q9Z0T9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Itgb6Q9Z0T9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Itgb6Q9Z0T9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb6Q9Z0T9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb6Q9Z0T9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb6Q9Z0T9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb6Q9Z0T9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb6Q9Z0T9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb6Q9Z0T9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb6Q9Z0T9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb6Q9Z0T9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb6Q9Z0T9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb6Q9Z0T9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb6Q9Z0T9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb6Q9Z0T9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb6Q9Z0T9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb6Q9Z0T9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgb6Q9Z0T9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgb6Q9Z0T9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgb6Q9Z0T9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgb6Q9Z0T9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb6Q9Z0T9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb6Q9Z0T9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb6Q9Z0T9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb6Q9Z0T9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb6Q9Z0T9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb6Q9Z0T9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb6Q9Z0T9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb6Q9Z0T9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb6Q9Z0T9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb6Q9Z0T9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb6Q9Z0T9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb6Q9Z0T9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itgb6Q9Z0T9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itgb6Q9Z0T9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itgb6Q9Z0T9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb6Q9Z0T9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb6Q9Z0T9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb6Q9Z0T9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb6Q9Z0T9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb6Q9Z0T9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itgb6Q9Z0T9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itgb6Q9Z0T9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itgb6Q9Z0T9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itgb6Q9Z0T9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb6Q9Z0T9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb6Q9Z0T9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb6Q9Z0T9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Itgb6Q9Z0T9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itgb6Q9Z0T9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms