Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Trpc5Q9QX29 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Trpc5Q9QX29 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Trpc5Q9QX29 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Trpc5Q9QX29 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Trpc5Q9QX29 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Trpc5Q9QX29 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Trpc5Q9QX29 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Trpc5Q9QX29 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Trpc5Q9QX29 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Trpc5Q9QX29 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Trpc5Q9QX29 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Trpc5Q9QX29 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Trpc5Q9QX29 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Trpc5Q9QX29 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Trpc5Q9QX29 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Trpc5Q9QX29 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Trpc5Q9QX29 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Trpc5Q9QX29 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Trpc5Q9QX29 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Trpc5Q9QX29 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Trpc5Q9QX29 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Trpc5Q9QX29 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Trpc5Q9QX29 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Trpc5Q9QX29 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Trpc5Q9QX29 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Trpc5Q9QX29 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Trpc5Q9QX29 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trpc5Q9QX29 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trpc5Q9QX29 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trpc5Q9QX29 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trpc5Q9QX29 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trpc5Q9QX29 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Trpc5Q9QX29 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trpc5Q9QX29 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Trpc5Q9QX29 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Trpc5Q9QX29 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Trpc5Q9QX29 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Trpc5Q9QX29 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Trpc5Q9QX29 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Trpc5Q9QX29 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Trpc5Q9QX29 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Trpc5Q9QX29 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Trpc5Q9QX29 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Trpc5Q9QX29 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Trpc5Q9QX29 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Trpc5Q9QX29 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Trpc5Q9QX29 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Trpc5Q9QX29 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Trpc5Q9QX29 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Trpc5Q9QX29 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trpc5Q9QX29 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trpc5Q9QX29 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Trpc5Q9QX29 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Trpc5Q9QX29 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Trpc5Q9QX29 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Trpc5Q9QX29 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Trpc5Q9QX29 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Trpc5Q9QX29 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Trpc5Q9QX29 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Trpc5Q9QX29 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trpc5Q9QX29 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trpc5Q9QX29 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Trpc5Q9QX29 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Trpc5Q9QX29 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Trpc5Q9QX29 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Trpc5Q9QX29 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Trpc5Q9QX29 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Trpc5Q9QX29 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Trpc5Q9QX29 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Trpc5Q9QX29 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Trpc5Q9QX29 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Trpc5Q9QX29 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Trpc5Q9QX29 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Trpc5Q9QX29 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Trpc5Q9QX29 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Trpc5Q9QX29 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Trpc5Q9QX29 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Trpc5Q9QX29 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Trpc5Q9QX29 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Trpc5Q9QX29 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Trpc5Q9QX29 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Trpc5Q9QX29 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Trpc5Q9QX29 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Trpc5Q9QX29 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trpc5Q9QX29 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trpc5Q9QX29 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trpc5Q9QX29 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trpc5Q9QX29 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trpc5Q9QX29 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Trpc5Q9QX29 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trpc5Q9QX29 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trpc5Q9QX29 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Trpc5Q9QX29 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Trpc5Q9QX29 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Trpc5Q9QX29 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Trpc5Q9QX29 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Trpc5Q9QX29 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Trpc5Q9QX29 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Trpc5Q9QX29 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms