Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
MsraQ9D6Y7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MsraQ9D6Y7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MsraQ9D6Y7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MsraQ9D6Y7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MsraQ9D6Y7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MsraQ9D6Y7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MsraQ9D6Y7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MsraQ9D6Y7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MsraQ9D6Y7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MsraQ9D6Y7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
MsraQ9D6Y7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MsraQ9D6Y7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MsraQ9D6Y7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
MsraQ9D6Y7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MsraQ9D6Y7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MsraQ9D6Y7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MsraQ9D6Y7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MsraQ9D6Y7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MsraQ9D6Y7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MsraQ9D6Y7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
MsraQ9D6Y7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MsraQ9D6Y7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MsraQ9D6Y7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MsraQ9D6Y7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MsraQ9D6Y7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MsraQ9D6Y7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MsraQ9D6Y7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MsraQ9D6Y7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MsraQ9D6Y7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MsraQ9D6Y7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MsraQ9D6Y7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
MsraQ9D6Y7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MsraQ9D6Y7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
MsraQ9D6Y7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MsraQ9D6Y7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MsraQ9D6Y7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MsraQ9D6Y7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MsraQ9D6Y7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MsraQ9D6Y7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MsraQ9D6Y7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MsraQ9D6Y7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MsraQ9D6Y7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MsraQ9D6Y7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MsraQ9D6Y7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MsraQ9D6Y7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MsraQ9D6Y7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MsraQ9D6Y7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MsraQ9D6Y7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MsraQ9D6Y7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MsraQ9D6Y7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
MsraQ9D6Y7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MsraQ9D6Y7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MsraQ9D6Y7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MsraQ9D6Y7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MsraQ9D6Y7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MsraQ9D6Y7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MsraQ9D6Y7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MsraQ9D6Y7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MsraQ9D6Y7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MsraQ9D6Y7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MsraQ9D6Y7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MsraQ9D6Y7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MsraQ9D6Y7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MsraQ9D6Y7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MsraQ9D6Y7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MsraQ9D6Y7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MsraQ9D6Y7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MsraQ9D6Y7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MsraQ9D6Y7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MsraQ9D6Y7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MsraQ9D6Y7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MsraQ9D6Y7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MsraQ9D6Y7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MsraQ9D6Y7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MsraQ9D6Y7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MsraQ9D6Y7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MsraQ9D6Y7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MsraQ9D6Y7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MsraQ9D6Y7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
MsraQ9D6Y7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MsraQ9D6Y7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MsraQ9D6Y7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MsraQ9D6Y7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
MsraQ9D6Y7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MsraQ9D6Y7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MsraQ9D6Y7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MsraQ9D6Y7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MsraQ9D6Y7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MsraQ9D6Y7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MsraQ9D6Y7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MsraQ9D6Y7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MsraQ9D6Y7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MsraQ9D6Y7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MsraQ9D6Y7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MsraQ9D6Y7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MsraQ9D6Y7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MsraQ9D6Y7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MsraQ9D6Y7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
MsraQ9D6Y7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.8 ms