Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl55Q9CZ83 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl55Q9CZ83 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl55Q9CZ83 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mrpl55Q9CZ83 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mrpl55Q9CZ83 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mrpl55Q9CZ83 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl55Q9CZ83 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl55Q9CZ83 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl55Q9CZ83 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl55Q9CZ83 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl55Q9CZ83 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl55Q9CZ83 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl55Q9CZ83 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl55Q9CZ83 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl55Q9CZ83 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl55Q9CZ83 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl55Q9CZ83 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl55Q9CZ83 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl55Q9CZ83 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl55Q9CZ83 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl55Q9CZ83 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl55Q9CZ83 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl55Q9CZ83 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl55Q9CZ83 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl55Q9CZ83 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl55Q9CZ83 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl55Q9CZ83 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl55Q9CZ83 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl55Q9CZ83 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl55Q9CZ83 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl55Q9CZ83 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl55Q9CZ83 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl55Q9CZ83 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl55Q9CZ83 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl55Q9CZ83 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl55Q9CZ83 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl55Q9CZ83 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl55Q9CZ83 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl55Q9CZ83 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl55Q9CZ83 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl55Q9CZ83 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl55Q9CZ83 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mrpl55Q9CZ83 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mrpl55Q9CZ83 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mrpl55Q9CZ83 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl55Q9CZ83 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl55Q9CZ83 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl55Q9CZ83 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl55Q9CZ83 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl55Q9CZ83 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl55Q9CZ83 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl55Q9CZ83 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl55Q9CZ83 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl55Q9CZ83 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl55Q9CZ83 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl55Q9CZ83 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl55Q9CZ83 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl55Q9CZ83 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl55Q9CZ83 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl55Q9CZ83 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl55Q9CZ83 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl55Q9CZ83 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl55Q9CZ83 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl55Q9CZ83 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl55Q9CZ83 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl55Q9CZ83 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl55Q9CZ83 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mrpl55Q9CZ83 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mrpl55Q9CZ83 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Mrpl55Q9CZ83 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mrpl55Q9CZ83 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mrpl55Q9CZ83 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mrpl55Q9CZ83 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mrpl55Q9CZ83 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mrpl55Q9CZ83 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mrpl55Q9CZ83 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mrpl55Q9CZ83 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mrpl55Q9CZ83 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mrpl55Q9CZ83 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mrpl55Q9CZ83 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mrpl55Q9CZ83 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mrpl55Q9CZ83 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Mrpl55Q9CZ83 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Mrpl55Q9CZ83 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl55Q9CZ83 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl55Q9CZ83 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl55Q9CZ83 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl55Q9CZ83 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl55Q9CZ83 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl55Q9CZ83 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl55Q9CZ83 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl55Q9CZ83 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl55Q9CZ83 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl55Q9CZ83 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl55Q9CZ83 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl55Q9CZ83 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl55Q9CZ83 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl55Q9CZ83 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl55Q9CZ83 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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