Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tm2d1Q99MB3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tm2d1Q99MB3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tm2d1Q99MB3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tm2d1Q99MB3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tm2d1Q99MB3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tm2d1Q99MB3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tm2d1Q99MB3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tm2d1Q99MB3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tm2d1Q99MB3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tm2d1Q99MB3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tm2d1Q99MB3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tm2d1Q99MB3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tm2d1Q99MB3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tm2d1Q99MB3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tm2d1Q99MB3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tm2d1Q99MB3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tm2d1Q99MB3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tm2d1Q99MB3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tm2d1Q99MB3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tm2d1Q99MB3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tm2d1Q99MB3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tm2d1Q99MB3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tm2d1Q99MB3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tm2d1Q99MB3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tm2d1Q99MB3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tm2d1Q99MB3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tm2d1Q99MB3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm2d1Q99MB3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm2d1Q99MB3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm2d1Q99MB3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm2d1Q99MB3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm2d1Q99MB3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm2d1Q99MB3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm2d1Q99MB3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm2d1Q99MB3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm2d1Q99MB3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm2d1Q99MB3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm2d1Q99MB3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm2d1Q99MB3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm2d1Q99MB3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm2d1Q99MB3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm2d1Q99MB3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm2d1Q99MB3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm2d1Q99MB3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm2d1Q99MB3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm2d1Q99MB3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm2d1Q99MB3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm2d1Q99MB3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm2d1Q99MB3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm2d1Q99MB3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm2d1Q99MB3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm2d1Q99MB3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm2d1Q99MB3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tm2d1Q99MB3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tm2d1Q99MB3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tm2d1Q99MB3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tm2d1Q99MB3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm2d1Q99MB3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm2d1Q99MB3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm2d1Q99MB3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm2d1Q99MB3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm2d1Q99MB3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tm2d1Q99MB3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tm2d1Q99MB3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tm2d1Q99MB3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tm2d1Q99MB3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tm2d1Q99MB3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tm2d1Q99MB3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tm2d1Q99MB3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tm2d1Q99MB3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tm2d1Q99MB3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tm2d1Q99MB3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tm2d1Q99MB3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tm2d1Q99MB3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tm2d1Q99MB3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tm2d1Q99MB3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tm2d1Q99MB3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tm2d1Q99MB3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tm2d1Q99MB3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tm2d1Q99MB3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tm2d1Q99MB3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tm2d1Q99MB3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tm2d1Q99MB3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tm2d1Q99MB3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tm2d1Q99MB3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tm2d1Q99MB3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tm2d1Q99MB3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tm2d1Q99MB3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tm2d1Q99MB3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tm2d1Q99MB3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tm2d1Q99MB3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tm2d1Q99MB3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tm2d1Q99MB3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tm2d1Q99MB3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tm2d1Q99MB3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tm2d1Q99MB3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tm2d1Q99MB3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tm2d1Q99MB3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tm2d1Q99MB3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms