Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
PdgfdQ925I7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
PdgfdQ925I7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27,99■■■□□ 2,07
PdgfdQ925I7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
PdgfdQ925I7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
PdgfdQ925I7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
PdgfdQ925I7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27,98■■■□□ 2,07
PdgfdQ925I7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27,97■■■□□ 2,07
PdgfdQ925I7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
PdgfdQ925I7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
PdgfdQ925I7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,96■■■□□ 2,07
PdgfdQ925I7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
PdgfdQ925I7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27,96■■■□□ 2,07
PdgfdQ925I7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27,96■■■□□ 2,07
PdgfdQ925I7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27,95■■■□□ 2,06
PdgfdQ925I7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
PdgfdQ925I7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
PdgfdQ925I7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27,94■■■□□ 2,06
PdgfdQ925I7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
PdgfdQ925I7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27,93■■■□□ 2,06
PdgfdQ925I7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
PdgfdQ925I7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27,93■■■□□ 2,06
PdgfdQ925I7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
PdgfdQ925I7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27,92■■■□□ 2,06
PdgfdQ925I7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
PdgfdQ925I7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
PdgfdQ925I7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27,9■■■□□ 2,06
PdgfdQ925I7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27,9■■■□□ 2,06
PdgfdQ925I7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27,9■■■□□ 2,06
PdgfdQ925I7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
PdgfdQ925I7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
PdgfdQ925I7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
PdgfdQ925I7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27,86■■■□□ 2,05
PdgfdQ925I7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
PdgfdQ925I7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27,85■■■□□ 2,05
PdgfdQ925I7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27,84■■■□□ 2,05
PdgfdQ925I7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
PdgfdQ925I7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,84■■■□□ 2,05
PdgfdQ925I7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
PdgfdQ925I7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,83■■■□□ 2,05
PdgfdQ925I7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27,83■■■□□ 2,05
PdgfdQ925I7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27,82■■■□□ 2,04
PdgfdQ925I7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27,82■■■□□ 2,04
PdgfdQ925I7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
PdgfdQ925I7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
PdgfdQ925I7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
PdgfdQ925I7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27,8■■■□□ 2,04
PdgfdQ925I7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
PdgfdQ925I7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
PdgfdQ925I7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
PdgfdQ925I7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27,78■■■□□ 2,04
PdgfdQ925I7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
PdgfdQ925I7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
PdgfdQ925I7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,77■■■□□ 2,04
PdgfdQ925I7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27,77■■■□□ 2,04
PdgfdQ925I7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
PdgfdQ925I7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27,76■■■□□ 2,03
PdgfdQ925I7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27,76■■■□□ 2,03
PdgfdQ925I7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
PdgfdQ925I7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
PdgfdQ925I7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27,75■■■□□ 2,03
PdgfdQ925I7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
PdgfdQ925I7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27,75■■■□□ 2,03
PdgfdQ925I7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27,75■■■□□ 2,03
PdgfdQ925I7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,75■■■□□ 2,03
PdgfdQ925I7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,74■■■□□ 2,03
PdgfdQ925I7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27,74■■■□□ 2,03
PdgfdQ925I7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
PdgfdQ925I7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27,73■■■□□ 2,03
PdgfdQ925I7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27,72■■■□□ 2,03
PdgfdQ925I7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27,71■■■□□ 2,03
PdgfdQ925I7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27,71■■■□□ 2,03
PdgfdQ925I7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27,71■■■□□ 2,03
PdgfdQ925I7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
PdgfdQ925I7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
PdgfdQ925I7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
PdgfdQ925I7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,69■■■□□ 2,02
PdgfdQ925I7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27,69■■■□□ 2,02
PdgfdQ925I7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
PdgfdQ925I7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
PdgfdQ925I7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27,68■■■□□ 2,02
PdgfdQ925I7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
PdgfdQ925I7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27,67■■■□□ 2,02
PdgfdQ925I7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
PdgfdQ925I7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
PdgfdQ925I7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27,66■■■□□ 2,02
PdgfdQ925I7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
PdgfdQ925I7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
PdgfdQ925I7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
PdgfdQ925I7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
PdgfdQ925I7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
PdgfdQ925I7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
PdgfdQ925I7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27,64■■■□□ 2,02
PdgfdQ925I7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27,64■■■□□ 2,02
PdgfdQ925I7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
PdgfdQ925I7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,01
PdgfdQ925I7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,63■■■□□ 2,01
PdgfdQ925I7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27,63■■■□□ 2,01
PdgfdQ925I7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27,63■■■□□ 2,01
PdgfdQ925I7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27,63■■■□□ 2,01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,2 ms