Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcf3Q8K268 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcf3Q8K268 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcf3Q8K268 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcf3Q8K268 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcf3Q8K268 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcf3Q8K268 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcf3Q8K268 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcf3Q8K268 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcf3Q8K268 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcf3Q8K268 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcf3Q8K268 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcf3Q8K268 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcf3Q8K268 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcf3Q8K268 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcf3Q8K268 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcf3Q8K268 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcf3Q8K268 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcf3Q8K268 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcf3Q8K268 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcf3Q8K268 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcf3Q8K268 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcf3Q8K268 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcf3Q8K268 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcf3Q8K268 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcf3Q8K268 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcf3Q8K268 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcf3Q8K268 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcf3Q8K268 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcf3Q8K268 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcf3Q8K268 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcf3Q8K268 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcf3Q8K268 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcf3Q8K268 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcf3Q8K268 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcf3Q8K268 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcf3Q8K268 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcf3Q8K268 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcf3Q8K268 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcf3Q8K268 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcf3Q8K268 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcf3Q8K268 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcf3Q8K268 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcf3Q8K268 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcf3Q8K268 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcf3Q8K268 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcf3Q8K268 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcf3Q8K268 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcf3Q8K268 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcf3Q8K268 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Abcf3Q8K268 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Abcf3Q8K268 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Abcf3Q8K268 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Abcf3Q8K268 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Abcf3Q8K268 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcf3Q8K268 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcf3Q8K268 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcf3Q8K268 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcf3Q8K268 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcf3Q8K268 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcf3Q8K268 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcf3Q8K268 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcf3Q8K268 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcf3Q8K268 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcf3Q8K268 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcf3Q8K268 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcf3Q8K268 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcf3Q8K268 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcf3Q8K268 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Abcf3Q8K268 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Abcf3Q8K268 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Abcf3Q8K268 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcf3Q8K268 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcf3Q8K268 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcf3Q8K268 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcf3Q8K268 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcf3Q8K268 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcf3Q8K268 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Abcf3Q8K268 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Abcf3Q8K268 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abcf3Q8K268 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abcf3Q8K268 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abcf3Q8K268 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcf3Q8K268 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcf3Q8K268 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcf3Q8K268 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcf3Q8K268 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcf3Q8K268 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcf3Q8K268 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcf3Q8K268 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcf3Q8K268 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcf3Q8K268 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcf3Q8K268 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcf3Q8K268 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcf3Q8K268 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcf3Q8K268 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcf3Q8K268 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcf3Q8K268 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcf3Q8K268 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcf3Q8K268 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms