Protein–RNA interactions for Protein: Q6XJV4

Cd200r4, Cell surface glycoprotein CD200 receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd200r4Q6XJV4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd200r4Q6XJV4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd200r4Q6XJV4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd200r4Q6XJV4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd200r4Q6XJV4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd200r4Q6XJV4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd200r4Q6XJV4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd200r4Q6XJV4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd200r4Q6XJV4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd200r4Q6XJV4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd200r4Q6XJV4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd200r4Q6XJV4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd200r4Q6XJV4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd200r4Q6XJV4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd200r4Q6XJV4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd200r4Q6XJV4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd200r4Q6XJV4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd200r4Q6XJV4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd200r4Q6XJV4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd200r4Q6XJV4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd200r4Q6XJV4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd200r4Q6XJV4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd200r4Q6XJV4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd200r4Q6XJV4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd200r4Q6XJV4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd200r4Q6XJV4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd200r4Q6XJV4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd200r4Q6XJV4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd200r4Q6XJV4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd200r4Q6XJV4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd200r4Q6XJV4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd200r4Q6XJV4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd200r4Q6XJV4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd200r4Q6XJV4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd200r4Q6XJV4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd200r4Q6XJV4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd200r4Q6XJV4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd200r4Q6XJV4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd200r4Q6XJV4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd200r4Q6XJV4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd200r4Q6XJV4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd200r4Q6XJV4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd200r4Q6XJV4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd200r4Q6XJV4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd200r4Q6XJV4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd200r4Q6XJV4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd200r4Q6XJV4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd200r4Q6XJV4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd200r4Q6XJV4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd200r4Q6XJV4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd200r4Q6XJV4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd200r4Q6XJV4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd200r4Q6XJV4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd200r4Q6XJV4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd200r4Q6XJV4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd200r4Q6XJV4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd200r4Q6XJV4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd200r4Q6XJV4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd200r4Q6XJV4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd200r4Q6XJV4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd200r4Q6XJV4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd200r4Q6XJV4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd200r4Q6XJV4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd200r4Q6XJV4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd200r4Q6XJV4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd200r4Q6XJV4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd200r4Q6XJV4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd200r4Q6XJV4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd200r4Q6XJV4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd200r4Q6XJV4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd200r4Q6XJV4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd200r4Q6XJV4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd200r4Q6XJV4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd200r4Q6XJV4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd200r4Q6XJV4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd200r4Q6XJV4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cd200r4Q6XJV4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cd200r4Q6XJV4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd200r4Q6XJV4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd200r4Q6XJV4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd200r4Q6XJV4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd200r4Q6XJV4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd200r4Q6XJV4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd200r4Q6XJV4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd200r4Q6XJV4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd200r4Q6XJV4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd200r4Q6XJV4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd200r4Q6XJV4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd200r4Q6XJV4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd200r4Q6XJV4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd200r4Q6XJV4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd200r4Q6XJV4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd200r4Q6XJV4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd200r4Q6XJV4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd200r4Q6XJV4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd200r4Q6XJV4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd200r4Q6XJV4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd200r4Q6XJV4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd200r4Q6XJV4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd200r4Q6XJV4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms