Protein–RNA interactions for Protein: Q62167

Ddx3x, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx3xQ62167 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ddx3xQ62167 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ddx3xQ62167 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ddx3xQ62167 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddx3xQ62167 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddx3xQ62167 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddx3xQ62167 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddx3xQ62167 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddx3xQ62167 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddx3xQ62167 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ddx3xQ62167 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ddx3xQ62167 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ddx3xQ62167 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ddx3xQ62167 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddx3xQ62167 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddx3xQ62167 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddx3xQ62167 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddx3xQ62167 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddx3xQ62167 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddx3xQ62167 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddx3xQ62167 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ddx3xQ62167 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ddx3xQ62167 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ddx3xQ62167 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ddx3xQ62167 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ddx3xQ62167 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ddx3xQ62167 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ddx3xQ62167 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ddx3xQ62167 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ddx3xQ62167 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ddx3xQ62167 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ddx3xQ62167 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ddx3xQ62167 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ddx3xQ62167 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ddx3xQ62167 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddx3xQ62167 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddx3xQ62167 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ddx3xQ62167 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ddx3xQ62167 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ddx3xQ62167 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ddx3xQ62167 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ddx3xQ62167 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ddx3xQ62167 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ddx3xQ62167 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ddx3xQ62167 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ddx3xQ62167 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ddx3xQ62167 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ddx3xQ62167 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ddx3xQ62167 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ddx3xQ62167 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ddx3xQ62167 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ddx3xQ62167 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ddx3xQ62167 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ddx3xQ62167 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ddx3xQ62167 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddx3xQ62167 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddx3xQ62167 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddx3xQ62167 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddx3xQ62167 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddx3xQ62167 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddx3xQ62167 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddx3xQ62167 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddx3xQ62167 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddx3xQ62167 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddx3xQ62167 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddx3xQ62167 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddx3xQ62167 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddx3xQ62167 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddx3xQ62167 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddx3xQ62167 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddx3xQ62167 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx3xQ62167 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx3xQ62167 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx3xQ62167 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx3xQ62167 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx3xQ62167 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx3xQ62167 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ddx3xQ62167 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ddx3xQ62167 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ddx3xQ62167 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ddx3xQ62167 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ddx3xQ62167 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ddx3xQ62167 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddx3xQ62167 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddx3xQ62167 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddx3xQ62167 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddx3xQ62167 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddx3xQ62167 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddx3xQ62167 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddx3xQ62167 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddx3xQ62167 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddx3xQ62167 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddx3xQ62167 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddx3xQ62167 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddx3xQ62167 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddx3xQ62167 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ddx3xQ62167 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ddx3xQ62167 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ddx3xQ62167 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ddx3xQ62167 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.5 ms