Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Sf3b2Q3UJB0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Sf3b2Q3UJB0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Sf3b2Q3UJB0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Sf3b2Q3UJB0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Sf3b2Q3UJB0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Sf3b2Q3UJB0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Sf3b2Q3UJB0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Sf3b2Q3UJB0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Sf3b2Q3UJB0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Sf3b2Q3UJB0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Sf3b2Q3UJB0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Sf3b2Q3UJB0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Sf3b2Q3UJB0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Sf3b2Q3UJB0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Sf3b2Q3UJB0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Sf3b2Q3UJB0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Sf3b2Q3UJB0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Sf3b2Q3UJB0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Sf3b2Q3UJB0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Sf3b2Q3UJB0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Sf3b2Q3UJB0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Sf3b2Q3UJB0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Sf3b2Q3UJB0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Sf3b2Q3UJB0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Sf3b2Q3UJB0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Sf3b2Q3UJB0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Sf3b2Q3UJB0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Sf3b2Q3UJB0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Sf3b2Q3UJB0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Sf3b2Q3UJB0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
Sf3b2Q3UJB0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Sf3b2Q3UJB0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Sf3b2Q3UJB0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Sf3b2Q3UJB0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Sf3b2Q3UJB0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Sf3b2Q3UJB0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
Sf3b2Q3UJB0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Sf3b2Q3UJB0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Sf3b2Q3UJB0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Sf3b2Q3UJB0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Sf3b2Q3UJB0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Sf3b2Q3UJB0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Sf3b2Q3UJB0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Sf3b2Q3UJB0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Sf3b2Q3UJB0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Sf3b2Q3UJB0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Sf3b2Q3UJB0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Sf3b2Q3UJB0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Sf3b2Q3UJB0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Sf3b2Q3UJB0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Sf3b2Q3UJB0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Sf3b2Q3UJB0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Sf3b2Q3UJB0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Sf3b2Q3UJB0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Sf3b2Q3UJB0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Sf3b2Q3UJB0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Sf3b2Q3UJB0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Sf3b2Q3UJB0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Sf3b2Q3UJB0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Sf3b2Q3UJB0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Sf3b2Q3UJB0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Sf3b2Q3UJB0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Sf3b2Q3UJB0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Sf3b2Q3UJB0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Sf3b2Q3UJB0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Sf3b2Q3UJB0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Sf3b2Q3UJB0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Sf3b2Q3UJB0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Sf3b2Q3UJB0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Sf3b2Q3UJB0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Sf3b2Q3UJB0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Sf3b2Q3UJB0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Sf3b2Q3UJB0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Sf3b2Q3UJB0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Sf3b2Q3UJB0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Sf3b2Q3UJB0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Sf3b2Q3UJB0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Sf3b2Q3UJB0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Sf3b2Q3UJB0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Sf3b2Q3UJB0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Sf3b2Q3UJB0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Sf3b2Q3UJB0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Sf3b2Q3UJB0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Sf3b2Q3UJB0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Sf3b2Q3UJB0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Sf3b2Q3UJB0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Sf3b2Q3UJB0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Sf3b2Q3UJB0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Sf3b2Q3UJB0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Sf3b2Q3UJB0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Sf3b2Q3UJB0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Sf3b2Q3UJB0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Sf3b2Q3UJB0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Sf3b2Q3UJB0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Sf3b2Q3UJB0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Sf3b2Q3UJB0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Sf3b2Q3UJB0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Sf3b2Q3UJB0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Sf3b2Q3UJB0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms