Protein–RNA interactions for Protein: Q30KN8

Defb25, Beta-defensin 25, mousemouse

Predictions only

Length 71 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb25Q30KN8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Defb25Q30KN8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Defb25Q30KN8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Defb25Q30KN8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Defb25Q30KN8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25■■□□□ 1.59
Defb25Q30KN8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Defb25Q30KN8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Defb25Q30KN8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Defb25Q30KN8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Defb25Q30KN8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Defb25Q30KN8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Defb25Q30KN8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Defb25Q30KN8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Defb25Q30KN8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Defb25Q30KN8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Defb25Q30KN8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Defb25Q30KN8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Defb25Q30KN8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Defb25Q30KN8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Defb25Q30KN8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Defb25Q30KN8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Defb25Q30KN8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Defb25Q30KN8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Defb25Q30KN8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Defb25Q30KN8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Defb25Q30KN8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Defb25Q30KN8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Defb25Q30KN8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Defb25Q30KN8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Defb25Q30KN8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Defb25Q30KN8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Defb25Q30KN8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Defb25Q30KN8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Defb25Q30KN8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Defb25Q30KN8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Defb25Q30KN8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Defb25Q30KN8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Defb25Q30KN8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Defb25Q30KN8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Defb25Q30KN8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Defb25Q30KN8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Defb25Q30KN8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Defb25Q30KN8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Defb25Q30KN8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Defb25Q30KN8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Defb25Q30KN8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Defb25Q30KN8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Defb25Q30KN8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Defb25Q30KN8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Defb25Q30KN8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Defb25Q30KN8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Defb25Q30KN8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Defb25Q30KN8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Defb25Q30KN8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Defb25Q30KN8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Defb25Q30KN8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Defb25Q30KN8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Defb25Q30KN8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Defb25Q30KN8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Defb25Q30KN8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Defb25Q30KN8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Defb25Q30KN8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Defb25Q30KN8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Defb25Q30KN8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Defb25Q30KN8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Defb25Q30KN8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Defb25Q30KN8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Defb25Q30KN8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Defb25Q30KN8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Defb25Q30KN8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Defb25Q30KN8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Defb25Q30KN8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Defb25Q30KN8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Defb25Q30KN8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Defb25Q30KN8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Defb25Q30KN8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Defb25Q30KN8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Defb25Q30KN8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Defb25Q30KN8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Defb25Q30KN8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Defb25Q30KN8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Defb25Q30KN8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Defb25Q30KN8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Defb25Q30KN8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Defb25Q30KN8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Defb25Q30KN8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Defb25Q30KN8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Defb25Q30KN8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Defb25Q30KN8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Defb25Q30KN8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Defb25Q30KN8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Defb25Q30KN8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Defb25Q30KN8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Defb25Q30KN8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Defb25Q30KN8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Defb25Q30KN8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Defb25Q30KN8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Defb25Q30KN8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Defb25Q30KN8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Defb25Q30KN8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms