Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,26■■■□□ 2,12
Col24a1Q30D77 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,26■■■□□ 2,11
Col24a1Q30D77 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28,26■■■□□ 2,11
Col24a1Q30D77 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Col24a1Q30D77 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28,24■■■□□ 2,11
Col24a1Q30D77 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Col24a1Q30D77 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28,24■■■□□ 2,11
Col24a1Q30D77 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Col24a1Q30D77 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Col24a1Q30D77 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Col24a1Q30D77 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Col24a1Q30D77 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Col24a1Q30D77 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Col24a1Q30D77 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Col24a1Q30D77 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Col24a1Q30D77 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Col24a1Q30D77 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28,19■■■□□ 2,1
Col24a1Q30D77 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Col24a1Q30D77 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28,18■■■□□ 2,1
Col24a1Q30D77 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,17■■■□□ 2,1
Col24a1Q30D77 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Col24a1Q30D77 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,17■■■□□ 2,1
Col24a1Q30D77 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28,17■■■□□ 2,1
Col24a1Q30D77 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Col24a1Q30D77 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28,16■■■□□ 2,1
Col24a1Q30D77 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28,16■■■□□ 2,1
Col24a1Q30D77 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Col24a1Q30D77 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,15■■■□□ 2,1
Col24a1Q30D77 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28,14■■■□□ 2,1
Col24a1Q30D77 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,09
Col24a1Q30D77 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Col24a1Q30D77 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Col24a1Q30D77 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28,12■■■□□ 2,09
Col24a1Q30D77 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,12■■■□□ 2,09
Col24a1Q30D77 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Col24a1Q30D77 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Col24a1Q30D77 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28,1■■■□□ 2,09
Col24a1Q30D77 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28,09■■■□□ 2,09
Col24a1Q30D77 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Col24a1Q30D77 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Col24a1Q30D77 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Col24a1Q30D77 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Col24a1Q30D77 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Col24a1Q30D77 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Col24a1Q30D77 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Col24a1Q30D77 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Col24a1Q30D77 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Col24a1Q30D77 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Col24a1Q30D77 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Col24a1Q30D77 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,04■■■□□ 2,08
Col24a1Q30D77 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Col24a1Q30D77 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28,04■■■□□ 2,08
Col24a1Q30D77 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28,04■■■□□ 2,08
Col24a1Q30D77 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28,04■■■□□ 2,08
Col24a1Q30D77 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Col24a1Q30D77 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Col24a1Q30D77 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Col24a1Q30D77 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28,03■■■□□ 2,08
Col24a1Q30D77 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28,02■■■□□ 2,08
Col24a1Q30D77 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28,02■■■□□ 2,08
Col24a1Q30D77 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28,02■■■□□ 2,08
Col24a1Q30D77 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28,02■■■□□ 2,08
Col24a1Q30D77 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28,01■■■□□ 2,07
Col24a1Q30D77 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28,01■■■□□ 2,07
Col24a1Q30D77 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Col24a1Q30D77 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Col24a1Q30D77 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2,07
Col24a1Q30D77 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,99■■■□□ 2,07
Col24a1Q30D77 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Col24a1Q30D77 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27,98■■■□□ 2,07
Col24a1Q30D77 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27,97■■■□□ 2,07
Col24a1Q30D77 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Col24a1Q30D77 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27,97■■■□□ 2,07
Col24a1Q30D77 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Col24a1Q30D77 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27,97■■■□□ 2,07
Col24a1Q30D77 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27,96■■■□□ 2,07
Col24a1Q30D77 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Col24a1Q30D77 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Col24a1Q30D77 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27,95■■■□□ 2,07
Col24a1Q30D77 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27,95■■■□□ 2,07
Col24a1Q30D77 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27,95■■■□□ 2,07
Col24a1Q30D77 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,07
Col24a1Q30D77 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Col24a1Q30D77 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27,94■■■□□ 2,06
Col24a1Q30D77 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Col24a1Q30D77 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Col24a1Q30D77 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Col24a1Q30D77 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Col24a1Q30D77 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Col24a1Q30D77 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Col24a1Q30D77 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Col24a1Q30D77 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Col24a1Q30D77 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Col24a1Q30D77 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Col24a1Q30D77 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Col24a1Q30D77 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27,92■■■□□ 2,06
Col24a1Q30D77 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27,92■■■□□ 2,06
Col24a1Q30D77 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Col24a1Q30D77 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27,91■■■□□ 2,06
Col24a1Q30D77 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43,9 ms