Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk18Q04899 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk18Q04899 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk18Q04899 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdk18Q04899 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk18Q04899 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk18Q04899 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk18Q04899 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk18Q04899 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk18Q04899 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk18Q04899 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk18Q04899 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk18Q04899 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk18Q04899 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk18Q04899 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk18Q04899 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk18Q04899 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk18Q04899 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk18Q04899 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk18Q04899 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk18Q04899 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk18Q04899 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk18Q04899 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk18Q04899 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk18Q04899 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk18Q04899 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdk18Q04899 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdk18Q04899 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cdk18Q04899 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdk18Q04899 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdk18Q04899 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdk18Q04899 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdk18Q04899 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdk18Q04899 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdk18Q04899 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdk18Q04899 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdk18Q04899 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk18Q04899 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk18Q04899 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk18Q04899 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk18Q04899 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk18Q04899 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk18Q04899 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk18Q04899 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk18Q04899 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk18Q04899 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk18Q04899 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk18Q04899 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk18Q04899 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk18Q04899 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk18Q04899 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk18Q04899 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk18Q04899 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk18Q04899 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk18Q04899 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk18Q04899 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk18Q04899 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk18Q04899 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk18Q04899 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk18Q04899 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk18Q04899 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk18Q04899 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk18Q04899 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk18Q04899 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk18Q04899 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk18Q04899 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk18Q04899 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdk18Q04899 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdk18Q04899 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk18Q04899 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk18Q04899 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk18Q04899 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk18Q04899 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk18Q04899 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk18Q04899 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk18Q04899 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk18Q04899 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk18Q04899 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk18Q04899 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdk18Q04899 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdk18Q04899 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdk18Q04899 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk18Q04899 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk18Q04899 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk18Q04899 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk18Q04899 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk18Q04899 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk18Q04899 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk18Q04899 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk18Q04899 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk18Q04899 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdk18Q04899 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdk18Q04899 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk18Q04899 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk18Q04899 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk18Q04899 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk18Q04899 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk18Q04899 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk18Q04899 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk18Q04899 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms