Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nhlh1Q02576 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nhlh1Q02576 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nhlh1Q02576 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nhlh1Q02576 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nhlh1Q02576 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nhlh1Q02576 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nhlh1Q02576 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nhlh1Q02576 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nhlh1Q02576 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nhlh1Q02576 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nhlh1Q02576 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nhlh1Q02576 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nhlh1Q02576 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nhlh1Q02576 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nhlh1Q02576 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nhlh1Q02576 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nhlh1Q02576 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nhlh1Q02576 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nhlh1Q02576 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nhlh1Q02576 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nhlh1Q02576 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nhlh1Q02576 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nhlh1Q02576 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Nhlh1Q02576 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nhlh1Q02576 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nhlh1Q02576 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nhlh1Q02576 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nhlh1Q02576 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nhlh1Q02576 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nhlh1Q02576 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nhlh1Q02576 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nhlh1Q02576 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nhlh1Q02576 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nhlh1Q02576 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nhlh1Q02576 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nhlh1Q02576 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nhlh1Q02576 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nhlh1Q02576 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nhlh1Q02576 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Nhlh1Q02576 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Nhlh1Q02576 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Nhlh1Q02576 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Nhlh1Q02576 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Nhlh1Q02576 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nhlh1Q02576 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Nhlh1Q02576 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nhlh1Q02576 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nhlh1Q02576 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nhlh1Q02576 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nhlh1Q02576 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nhlh1Q02576 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Nhlh1Q02576 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nhlh1Q02576 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nhlh1Q02576 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nhlh1Q02576 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nhlh1Q02576 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nhlh1Q02576 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nhlh1Q02576 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nhlh1Q02576 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nhlh1Q02576 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nhlh1Q02576 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nhlh1Q02576 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nhlh1Q02576 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nhlh1Q02576 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nhlh1Q02576 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nhlh1Q02576 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nhlh1Q02576 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nhlh1Q02576 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nhlh1Q02576 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nhlh1Q02576 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nhlh1Q02576 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nhlh1Q02576 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nhlh1Q02576 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Nhlh1Q02576 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nhlh1Q02576 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nhlh1Q02576 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nhlh1Q02576 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nhlh1Q02576 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nhlh1Q02576 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Nhlh1Q02576 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nhlh1Q02576 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Nhlh1Q02576 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nhlh1Q02576 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nhlh1Q02576 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nhlh1Q02576 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nhlh1Q02576 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nhlh1Q02576 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nhlh1Q02576 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nhlh1Q02576 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nhlh1Q02576 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nhlh1Q02576 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nhlh1Q02576 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nhlh1Q02576 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nhlh1Q02576 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nhlh1Q02576 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nhlh1Q02576 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nhlh1Q02576 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nhlh1Q02576 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nhlh1Q02576 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167 ms