Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Lama4P97927 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lama4P97927 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Lama4P97927 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Lama4P97927 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lama4P97927 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lama4P97927 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lama4P97927 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Lama4P97927 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Lama4P97927 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lama4P97927 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lama4P97927 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Lama4P97927 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lama4P97927 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lama4P97927 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lama4P97927 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lama4P97927 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Lama4P97927 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lama4P97927 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lama4P97927 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lama4P97927 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lama4P97927 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lama4P97927 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lama4P97927 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lama4P97927 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lama4P97927 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lama4P97927 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lama4P97927 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lama4P97927 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lama4P97927 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lama4P97927 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lama4P97927 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Lama4P97927 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Lama4P97927 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lama4P97927 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Lama4P97927 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lama4P97927 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lama4P97927 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lama4P97927 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lama4P97927 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Lama4P97927 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lama4P97927 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lama4P97927 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lama4P97927 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lama4P97927 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Lama4P97927 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lama4P97927 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lama4P97927 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lama4P97927 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lama4P97927 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Lama4P97927 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Lama4P97927 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Lama4P97927 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lama4P97927 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lama4P97927 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Lama4P97927 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Lama4P97927 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Lama4P97927 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lama4P97927 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lama4P97927 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lama4P97927 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lama4P97927 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lama4P97927 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lama4P97927 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lama4P97927 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lama4P97927 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lama4P97927 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lama4P97927 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Lama4P97927 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Lama4P97927 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Lama4P97927 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lama4P97927 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lama4P97927 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lama4P97927 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lama4P97927 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Lama4P97927 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Lama4P97927 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Lama4P97927 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Lama4P97927 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lama4P97927 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lama4P97927 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lama4P97927 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lama4P97927 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lama4P97927 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lama4P97927 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lama4P97927 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lama4P97927 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lama4P97927 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Lama4P97927 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Lama4P97927 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Lama4P97927 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Lama4P97927 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Lama4P97927 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Lama4P97927 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Lama4P97927 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Lama4P97927 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lama4P97927 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lama4P97927 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lama4P97927 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lama4P97927 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms