Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Tp53bp1P70399 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tp53bp1P70399 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Tp53bp1P70399 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tp53bp1P70399 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tp53bp1P70399 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tp53bp1P70399 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Tp53bp1P70399 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tp53bp1P70399 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tp53bp1P70399 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tp53bp1P70399 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tp53bp1P70399 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tp53bp1P70399 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tp53bp1P70399 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tp53bp1P70399 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Tp53bp1P70399 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tp53bp1P70399 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tp53bp1P70399 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tp53bp1P70399 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tp53bp1P70399 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tp53bp1P70399 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tp53bp1P70399 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tp53bp1P70399 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tp53bp1P70399 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tp53bp1P70399 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tp53bp1P70399 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tp53bp1P70399 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tp53bp1P70399 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tp53bp1P70399 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tp53bp1P70399 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tp53bp1P70399 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tp53bp1P70399 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tp53bp1P70399 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tp53bp1P70399 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Tp53bp1P70399 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Tp53bp1P70399 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tp53bp1P70399 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tp53bp1P70399 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Tp53bp1P70399 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tp53bp1P70399 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tp53bp1P70399 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tp53bp1P70399 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tp53bp1P70399 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tp53bp1P70399 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tp53bp1P70399 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tp53bp1P70399 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tp53bp1P70399 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tp53bp1P70399 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Tp53bp1P70399 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tp53bp1P70399 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tp53bp1P70399 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tp53bp1P70399 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tp53bp1P70399 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Tp53bp1P70399 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tp53bp1P70399 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tp53bp1P70399 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tp53bp1P70399 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tp53bp1P70399 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tp53bp1P70399 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tp53bp1P70399 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tp53bp1P70399 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tp53bp1P70399 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tp53bp1P70399 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tp53bp1P70399 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tp53bp1P70399 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tp53bp1P70399 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tp53bp1P70399 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tp53bp1P70399 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tp53bp1P70399 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tp53bp1P70399 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tp53bp1P70399 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tp53bp1P70399 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tp53bp1P70399 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tp53bp1P70399 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tp53bp1P70399 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tp53bp1P70399 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tp53bp1P70399 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tp53bp1P70399 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Tp53bp1P70399 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tp53bp1P70399 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Tp53bp1P70399 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tp53bp1P70399 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tp53bp1P70399 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tp53bp1P70399 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tp53bp1P70399 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tp53bp1P70399 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tp53bp1P70399 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tp53bp1P70399 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tp53bp1P70399 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tp53bp1P70399 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tp53bp1P70399 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tp53bp1P70399 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tp53bp1P70399 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tp53bp1P70399 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tp53bp1P70399 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tp53bp1P70399 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tp53bp1P70399 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tp53bp1P70399 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tp53bp1P70399 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tp53bp1P70399 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms