Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Defa-rs12P50716 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Defa-rs12P50716 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Defa-rs12P50716 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Defa-rs12P50716 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Defa-rs12P50716 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Defa-rs12P50716 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Defa-rs12P50716 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Defa-rs12P50716 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Defa-rs12P50716 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Defa-rs12P50716 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Defa-rs12P50716 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Defa-rs12P50716 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Defa-rs12P50716 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Defa-rs12P50716 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Defa-rs12P50716 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Defa-rs12P50716 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Defa-rs12P50716 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Defa-rs12P50716 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Defa-rs12P50716 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Defa-rs12P50716 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Defa-rs12P50716 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Defa-rs12P50716 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Defa-rs12P50716 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Defa-rs12P50716 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Defa-rs12P50716 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Defa-rs12P50716 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Defa-rs12P50716 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Defa-rs12P50716 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Defa-rs12P50716 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Defa-rs12P50716 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Defa-rs12P50716 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Defa-rs12P50716 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Defa-rs12P50716 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Defa-rs12P50716 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Defa-rs12P50716 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Defa-rs12P50716 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Defa-rs12P50716 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Defa-rs12P50716 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Defa-rs12P50716 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Defa-rs12P50716 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Defa-rs12P50716 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Defa-rs12P50716 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Defa-rs12P50716 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Defa-rs12P50716 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Defa-rs12P50716 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Defa-rs12P50716 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Defa-rs12P50716 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Defa-rs12P50716 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Defa-rs12P50716 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Defa-rs12P50716 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Defa-rs12P50716 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Defa-rs12P50716 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Defa-rs12P50716 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Defa-rs12P50716 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Defa-rs12P50716 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Defa-rs12P50716 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Defa-rs12P50716 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Defa-rs12P50716 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Defa-rs12P50716 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Defa-rs12P50716 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Defa-rs12P50716 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Defa-rs12P50716 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Defa-rs12P50716 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Defa-rs12P50716 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Defa-rs12P50716 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Defa-rs12P50716 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Defa-rs12P50716 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Defa-rs12P50716 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Defa-rs12P50716 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Defa-rs12P50716 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Defa-rs12P50716 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Defa-rs12P50716 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Defa-rs12P50716 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Defa-rs12P50716 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Defa-rs12P50716 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Defa-rs12P50716 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Defa-rs12P50716 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Defa-rs12P50716 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Defa-rs12P50716 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Defa-rs12P50716 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Defa-rs12P50716 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Defa-rs12P50716 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Defa-rs12P50716 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Defa-rs12P50716 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Defa-rs12P50716 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Defa-rs12P50716 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Defa-rs12P50716 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Defa-rs12P50716 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Defa-rs12P50716 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Defa-rs12P50716 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Defa-rs12P50716 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Defa-rs12P50716 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Defa-rs12P50716 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Defa-rs12P50716 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Defa-rs12P50716 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Defa-rs12P50716 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Defa-rs12P50716 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Defa-rs12P50716 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Defa-rs12P50716 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms