Protein–RNA interactions for Protein: P26011

Itgb7, Integrin beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb7P26011 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27■■□□□ 1.91
Itgb7P26011 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Itgb7P26011 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Itgb7P26011 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Itgb7P26011 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Itgb7P26011 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Itgb7P26011 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Itgb7P26011 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Itgb7P26011 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Itgb7P26011 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Itgb7P26011 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Itgb7P26011 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Itgb7P26011 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Itgb7P26011 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Itgb7P26011 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Itgb7P26011 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Itgb7P26011 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Itgb7P26011 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Itgb7P26011 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Itgb7P26011 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Itgb7P26011 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Itgb7P26011 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Itgb7P26011 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Itgb7P26011 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Itgb7P26011 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Itgb7P26011 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Itgb7P26011 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Itgb7P26011 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Itgb7P26011 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Itgb7P26011 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Itgb7P26011 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Itgb7P26011 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Itgb7P26011 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Itgb7P26011 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Itgb7P26011 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Itgb7P26011 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Itgb7P26011 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Itgb7P26011 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Itgb7P26011 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Itgb7P26011 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Itgb7P26011 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Itgb7P26011 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Itgb7P26011 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Itgb7P26011 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Itgb7P26011 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Itgb7P26011 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Itgb7P26011 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Itgb7P26011 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Itgb7P26011 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Itgb7P26011 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Itgb7P26011 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Itgb7P26011 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Itgb7P26011 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Itgb7P26011 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Itgb7P26011 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Itgb7P26011 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Itgb7P26011 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Itgb7P26011 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Itgb7P26011 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Itgb7P26011 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Itgb7P26011 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Itgb7P26011 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Itgb7P26011 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Itgb7P26011 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Itgb7P26011 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Itgb7P26011 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Itgb7P26011 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Itgb7P26011 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Itgb7P26011 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Itgb7P26011 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Itgb7P26011 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Itgb7P26011 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Itgb7P26011 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Itgb7P26011 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Itgb7P26011 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Itgb7P26011 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Itgb7P26011 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Itgb7P26011 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Itgb7P26011 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Itgb7P26011 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Itgb7P26011 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Itgb7P26011 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Itgb7P26011 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Itgb7P26011 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Itgb7P26011 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Itgb7P26011 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Itgb7P26011 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Itgb7P26011 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Itgb7P26011 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Itgb7P26011 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Itgb7P26011 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Itgb7P26011 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Itgb7P26011 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Itgb7P26011 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Itgb7P26011 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Itgb7P26011 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Itgb7P26011 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Itgb7P26011 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Itgb7P26011 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Itgb7P26011 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms