Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim30aP15533 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim30aP15533 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim30aP15533 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim30aP15533 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim30aP15533 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim30aP15533 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim30aP15533 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim30aP15533 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim30aP15533 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim30aP15533 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim30aP15533 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim30aP15533 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim30aP15533 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim30aP15533 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim30aP15533 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim30aP15533 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim30aP15533 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim30aP15533 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim30aP15533 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim30aP15533 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim30aP15533 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim30aP15533 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim30aP15533 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim30aP15533 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim30aP15533 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim30aP15533 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim30aP15533 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim30aP15533 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim30aP15533 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim30aP15533 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim30aP15533 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim30aP15533 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim30aP15533 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim30aP15533 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim30aP15533 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim30aP15533 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim30aP15533 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim30aP15533 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim30aP15533 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim30aP15533 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim30aP15533 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim30aP15533 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim30aP15533 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim30aP15533 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim30aP15533 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Trim30aP15533 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim30aP15533 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim30aP15533 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim30aP15533 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim30aP15533 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim30aP15533 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim30aP15533 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim30aP15533 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim30aP15533 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim30aP15533 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim30aP15533 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim30aP15533 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim30aP15533 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim30aP15533 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim30aP15533 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim30aP15533 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim30aP15533 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim30aP15533 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim30aP15533 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim30aP15533 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim30aP15533 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim30aP15533 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim30aP15533 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trim30aP15533 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trim30aP15533 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trim30aP15533 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trim30aP15533 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim30aP15533 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim30aP15533 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim30aP15533 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim30aP15533 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim30aP15533 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim30aP15533 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim30aP15533 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim30aP15533 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim30aP15533 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim30aP15533 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim30aP15533 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim30aP15533 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim30aP15533 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim30aP15533 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim30aP15533 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim30aP15533 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim30aP15533 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim30aP15533 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim30aP15533 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim30aP15533 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim30aP15533 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim30aP15533 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim30aP15533 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim30aP15533 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim30aP15533 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim30aP15533 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim30aP15533 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms