Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Egr1P08046 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Egr1P08046 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Egr1P08046 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Egr1P08046 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Egr1P08046 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Egr1P08046 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Egr1P08046 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Egr1P08046 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Egr1P08046 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Egr1P08046 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Egr1P08046 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Egr1P08046 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Egr1P08046 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Egr1P08046 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Egr1P08046 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Egr1P08046 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Egr1P08046 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Egr1P08046 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Egr1P08046 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Egr1P08046 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Egr1P08046 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Egr1P08046 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Egr1P08046 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Egr1P08046 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Egr1P08046 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Egr1P08046 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Egr1P08046 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Egr1P08046 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Egr1P08046 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Egr1P08046 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Egr1P08046 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Egr1P08046 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Egr1P08046 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Egr1P08046 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Egr1P08046 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Egr1P08046 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Egr1P08046 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Egr1P08046 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Egr1P08046 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Egr1P08046 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Egr1P08046 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Egr1P08046 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Egr1P08046 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Egr1P08046 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Egr1P08046 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Egr1P08046 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Egr1P08046 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Egr1P08046 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Egr1P08046 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Egr1P08046 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Egr1P08046 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Egr1P08046 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Egr1P08046 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Egr1P08046 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Egr1P08046 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Egr1P08046 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Egr1P08046 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Egr1P08046 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Egr1P08046 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Egr1P08046 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Egr1P08046 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Egr1P08046 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Egr1P08046 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Egr1P08046 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Egr1P08046 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Egr1P08046 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Egr1P08046 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Egr1P08046 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Egr1P08046 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Egr1P08046 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Egr1P08046 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Egr1P08046 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Egr1P08046 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Egr1P08046 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Egr1P08046 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Egr1P08046 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Egr1P08046 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Egr1P08046 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Egr1P08046 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Egr1P08046 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Egr1P08046 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Egr1P08046 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Egr1P08046 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Egr1P08046 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Egr1P08046 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Egr1P08046 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Egr1P08046 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Egr1P08046 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Egr1P08046 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Egr1P08046 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Egr1P08046 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Egr1P08046 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Egr1P08046 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Egr1P08046 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Egr1P08046 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Egr1P08046 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Egr1P08046 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Egr1P08046 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Egr1P08046 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms