Protein–RNA interactions for Protein: O88485

Dync1i1, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dync1i1O88485 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dync1i1O88485 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Dync1i1O88485 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Dync1i1O88485 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dync1i1O88485 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dync1i1O88485 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dync1i1O88485 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dync1i1O88485 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dync1i1O88485 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dync1i1O88485 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dync1i1O88485 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dync1i1O88485 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dync1i1O88485 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dync1i1O88485 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dync1i1O88485 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dync1i1O88485 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dync1i1O88485 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dync1i1O88485 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dync1i1O88485 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dync1i1O88485 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dync1i1O88485 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dync1i1O88485 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dync1i1O88485 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dync1i1O88485 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dync1i1O88485 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dync1i1O88485 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Dync1i1O88485 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dync1i1O88485 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dync1i1O88485 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dync1i1O88485 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dync1i1O88485 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dync1i1O88485 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dync1i1O88485 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dync1i1O88485 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dync1i1O88485 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dync1i1O88485 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dync1i1O88485 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dync1i1O88485 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dync1i1O88485 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dync1i1O88485 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dync1i1O88485 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dync1i1O88485 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dync1i1O88485 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dync1i1O88485 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dync1i1O88485 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dync1i1O88485 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dync1i1O88485 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dync1i1O88485 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dync1i1O88485 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dync1i1O88485 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dync1i1O88485 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dync1i1O88485 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dync1i1O88485 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Dync1i1O88485 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dync1i1O88485 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Dync1i1O88485 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dync1i1O88485 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dync1i1O88485 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dync1i1O88485 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dync1i1O88485 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dync1i1O88485 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dync1i1O88485 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dync1i1O88485 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dync1i1O88485 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dync1i1O88485 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dync1i1O88485 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dync1i1O88485 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dync1i1O88485 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dync1i1O88485 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dync1i1O88485 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dync1i1O88485 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dync1i1O88485 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dync1i1O88485 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dync1i1O88485 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dync1i1O88485 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dync1i1O88485 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dync1i1O88485 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dync1i1O88485 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dync1i1O88485 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dync1i1O88485 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dync1i1O88485 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dync1i1O88485 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dync1i1O88485 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Dync1i1O88485 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dync1i1O88485 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dync1i1O88485 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dync1i1O88485 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Dync1i1O88485 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dync1i1O88485 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dync1i1O88485 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dync1i1O88485 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dync1i1O88485 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dync1i1O88485 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dync1i1O88485 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dync1i1O88485 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dync1i1O88485 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dync1i1O88485 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dync1i1O88485 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dync1i1O88485 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dync1i1O88485 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms