Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Abcc1O35379 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Abcc1O35379 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Abcc1O35379 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Abcc1O35379 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Abcc1O35379 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Abcc1O35379 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Abcc1O35379 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Abcc1O35379 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Abcc1O35379 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
Abcc1O35379 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Abcc1O35379 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Abcc1O35379 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Abcc1O35379 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Abcc1O35379 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Abcc1O35379 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Abcc1O35379 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Abcc1O35379 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Abcc1O35379 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Abcc1O35379 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Abcc1O35379 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Abcc1O35379 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Abcc1O35379 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Abcc1O35379 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Abcc1O35379 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Abcc1O35379 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Abcc1O35379 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
Abcc1O35379 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Abcc1O35379 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Abcc1O35379 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Abcc1O35379 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Abcc1O35379 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Abcc1O35379 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC37.26■■■■□ 3.55
Abcc1O35379 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Abcc1O35379 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Abcc1O35379 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Abcc1O35379 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Abcc1O35379 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Abcc1O35379 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
Abcc1O35379 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
Abcc1O35379 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Abcc1O35379 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Abcc1O35379 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Abcc1O35379 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Abcc1O35379 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Abcc1O35379 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Abcc1O35379 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Abcc1O35379 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Abcc1O35379 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Abcc1O35379 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Abcc1O35379 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Abcc1O35379 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Abcc1O35379 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
Abcc1O35379 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Abcc1O35379 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Abcc1O35379 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Abcc1O35379 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Abcc1O35379 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Abcc1O35379 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Abcc1O35379 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Abcc1O35379 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Abcc1O35379 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Abcc1O35379 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Abcc1O35379 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Abcc1O35379 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Abcc1O35379 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Abcc1O35379 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Abcc1O35379 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Abcc1O35379 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Abcc1O35379 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Abcc1O35379 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Abcc1O35379 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Abcc1O35379 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Abcc1O35379 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Abcc1O35379 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Abcc1O35379 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Abcc1O35379 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Abcc1O35379 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
Abcc1O35379 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Abcc1O35379 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Abcc1O35379 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Abcc1O35379 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Abcc1O35379 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Abcc1O35379 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Abcc1O35379 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Abcc1O35379 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Abcc1O35379 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Abcc1O35379 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Abcc1O35379 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Abcc1O35379 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Abcc1O35379 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
Abcc1O35379 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Abcc1O35379 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
Abcc1O35379 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
Abcc1O35379 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Abcc1O35379 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Abcc1O35379 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
Abcc1O35379 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Abcc1O35379 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Abcc1O35379 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms