Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc85cE9Q6B2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc85cE9Q6B2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc85cE9Q6B2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc85cE9Q6B2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc85cE9Q6B2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc85cE9Q6B2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc85cE9Q6B2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc85cE9Q6B2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc85cE9Q6B2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc85cE9Q6B2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc85cE9Q6B2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc85cE9Q6B2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc85cE9Q6B2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc85cE9Q6B2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc85cE9Q6B2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc85cE9Q6B2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc85cE9Q6B2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc85cE9Q6B2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc85cE9Q6B2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc85cE9Q6B2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc85cE9Q6B2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc85cE9Q6B2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc85cE9Q6B2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc85cE9Q6B2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc85cE9Q6B2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc85cE9Q6B2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc85cE9Q6B2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc85cE9Q6B2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc85cE9Q6B2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc85cE9Q6B2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc85cE9Q6B2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc85cE9Q6B2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc85cE9Q6B2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc85cE9Q6B2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc85cE9Q6B2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc85cE9Q6B2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc85cE9Q6B2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccdc85cE9Q6B2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc85cE9Q6B2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc85cE9Q6B2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc85cE9Q6B2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc85cE9Q6B2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc85cE9Q6B2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ccdc85cE9Q6B2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ccdc85cE9Q6B2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Ccdc85cE9Q6B2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc85cE9Q6B2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccdc85cE9Q6B2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccdc85cE9Q6B2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccdc85cE9Q6B2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccdc85cE9Q6B2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc85cE9Q6B2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc85cE9Q6B2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc85cE9Q6B2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc85cE9Q6B2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc85cE9Q6B2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc85cE9Q6B2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc85cE9Q6B2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc85cE9Q6B2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc85cE9Q6B2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc85cE9Q6B2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccdc85cE9Q6B2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccdc85cE9Q6B2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccdc85cE9Q6B2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccdc85cE9Q6B2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccdc85cE9Q6B2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Ccdc85cE9Q6B2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc85cE9Q6B2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc85cE9Q6B2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc85cE9Q6B2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccdc85cE9Q6B2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccdc85cE9Q6B2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccdc85cE9Q6B2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccdc85cE9Q6B2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccdc85cE9Q6B2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccdc85cE9Q6B2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc85cE9Q6B2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc85cE9Q6B2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc85cE9Q6B2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc85cE9Q6B2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc85cE9Q6B2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ccdc85cE9Q6B2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ccdc85cE9Q6B2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ccdc85cE9Q6B2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc85cE9Q6B2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccdc85cE9Q6B2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms