Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Fndc1E9Q043 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Fndc1E9Q043 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Fndc1E9Q043 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Fndc1E9Q043 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.34
Fndc1E9Q043 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.34
Fndc1E9Q043 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
Fndc1E9Q043 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Fndc1E9Q043 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Fndc1E9Q043 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Fndc1E9Q043 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Fndc1E9Q043 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Fndc1E9Q043 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
Fndc1E9Q043 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Fndc1E9Q043 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Fndc1E9Q043 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Fndc1E9Q043 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Fndc1E9Q043 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Fndc1E9Q043 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Fndc1E9Q043 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Fndc1E9Q043 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Fndc1E9Q043 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Fndc1E9Q043 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Fndc1E9Q043 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Fndc1E9Q043 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Fndc1E9Q043 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Fndc1E9Q043 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Fndc1E9Q043 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Fndc1E9Q043 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Fndc1E9Q043 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
Fndc1E9Q043 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Fndc1E9Q043 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Fndc1E9Q043 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Fndc1E9Q043 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
Fndc1E9Q043 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Fndc1E9Q043 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Fndc1E9Q043 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Fndc1E9Q043 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Fndc1E9Q043 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Fndc1E9Q043 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Fndc1E9Q043 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Fndc1E9Q043 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
Fndc1E9Q043 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Fndc1E9Q043 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Fndc1E9Q043 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Fndc1E9Q043 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Fndc1E9Q043 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Fndc1E9Q043 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Fndc1E9Q043 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Fndc1E9Q043 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Fndc1E9Q043 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Fndc1E9Q043 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Fndc1E9Q043 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Fndc1E9Q043 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Fndc1E9Q043 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Fndc1E9Q043 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Fndc1E9Q043 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Fndc1E9Q043 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Fndc1E9Q043 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Fndc1E9Q043 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
Fndc1E9Q043 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Fndc1E9Q043 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Fndc1E9Q043 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Fndc1E9Q043 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Fndc1E9Q043 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Fndc1E9Q043 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Fndc1E9Q043 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Fndc1E9Q043 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Fndc1E9Q043 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Fndc1E9Q043 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Fndc1E9Q043 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Fndc1E9Q043 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Fndc1E9Q043 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Fndc1E9Q043 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Fndc1E9Q043 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Fndc1E9Q043 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Fndc1E9Q043 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
Fndc1E9Q043 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Fndc1E9Q043 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Fndc1E9Q043 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Fndc1E9Q043 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Fndc1E9Q043 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
Fndc1E9Q043 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Fndc1E9Q043 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
Fndc1E9Q043 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Fndc1E9Q043 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Fndc1E9Q043 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Fndc1E9Q043 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Fndc1E9Q043 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Fndc1E9Q043 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Fndc1E9Q043 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Fndc1E9Q043 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
Fndc1E9Q043 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Fndc1E9Q043 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Fndc1E9Q043 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Fndc1E9Q043 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Fndc1E9Q043 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Fndc1E9Q043 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Fndc1E9Q043 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Fndc1E9Q043 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms