Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ckap5A2AGT5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ckap5A2AGT5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ckap5A2AGT5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ckap5A2AGT5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ckap5A2AGT5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ckap5A2AGT5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ckap5A2AGT5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ckap5A2AGT5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ckap5A2AGT5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ckap5A2AGT5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ckap5A2AGT5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ckap5A2AGT5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ckap5A2AGT5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ckap5A2AGT5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ckap5A2AGT5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ckap5A2AGT5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ckap5A2AGT5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ckap5A2AGT5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ckap5A2AGT5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ckap5A2AGT5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ckap5A2AGT5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ckap5A2AGT5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ckap5A2AGT5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ckap5A2AGT5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ckap5A2AGT5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ckap5A2AGT5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ckap5A2AGT5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ckap5A2AGT5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ckap5A2AGT5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ckap5A2AGT5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ckap5A2AGT5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ckap5A2AGT5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ckap5A2AGT5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ckap5A2AGT5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ckap5A2AGT5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ckap5A2AGT5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ckap5A2AGT5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ckap5A2AGT5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ckap5A2AGT5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ckap5A2AGT5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ckap5A2AGT5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ckap5A2AGT5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ckap5A2AGT5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ckap5A2AGT5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ckap5A2AGT5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ckap5A2AGT5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ckap5A2AGT5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ckap5A2AGT5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ckap5A2AGT5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ckap5A2AGT5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ckap5A2AGT5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ckap5A2AGT5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ckap5A2AGT5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ckap5A2AGT5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ckap5A2AGT5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ckap5A2AGT5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ckap5A2AGT5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ckap5A2AGT5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ckap5A2AGT5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ckap5A2AGT5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ckap5A2AGT5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ckap5A2AGT5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ckap5A2AGT5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ckap5A2AGT5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ckap5A2AGT5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ckap5A2AGT5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ckap5A2AGT5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ckap5A2AGT5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ckap5A2AGT5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ckap5A2AGT5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ckap5A2AGT5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ckap5A2AGT5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ckap5A2AGT5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ckap5A2AGT5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ckap5A2AGT5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ckap5A2AGT5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ckap5A2AGT5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ckap5A2AGT5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ckap5A2AGT5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ckap5A2AGT5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ckap5A2AGT5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ckap5A2AGT5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ckap5A2AGT5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ckap5A2AGT5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ckap5A2AGT5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ckap5A2AGT5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ckap5A2AGT5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ckap5A2AGT5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ckap5A2AGT5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ckap5A2AGT5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ckap5A2AGT5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ckap5A2AGT5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ckap5A2AGT5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ckap5A2AGT5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ckap5A2AGT5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ckap5A2AGT5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ckap5A2AGT5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ckap5A2AGT5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ckap5A2AGT5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
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