Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
FOXF1Q12946 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FOXF1Q12946 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FOXF1Q12946 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FOXF1Q12946 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FOXF1Q12946 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FOXF1Q12946 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FOXF1Q12946 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FOXF1Q12946 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FOXF1Q12946 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FOXF1Q12946 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
FOXF1Q12946 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
FOXF1Q12946 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FOXF1Q12946 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXF1Q12946 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXF1Q12946 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXF1Q12946 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXF1Q12946 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXF1Q12946 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXF1Q12946 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXF1Q12946 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXF1Q12946 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXF1Q12946 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXF1Q12946 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXF1Q12946 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXF1Q12946 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXF1Q12946 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXF1Q12946 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXF1Q12946 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXF1Q12946 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXF1Q12946 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXF1Q12946 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXF1Q12946 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXF1Q12946 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXF1Q12946 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXF1Q12946 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXF1Q12946 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXF1Q12946 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXF1Q12946 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXF1Q12946 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXF1Q12946 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXF1Q12946 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXF1Q12946 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXF1Q12946 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXF1Q12946 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXF1Q12946 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXF1Q12946 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXF1Q12946 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXF1Q12946 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.9 ms