Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.8 ms