Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PSDA5PKW4 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms