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| CHCHD4 | Q8N4Q1 | MS4A14-202 | ENST00000395001 | 3401 nt | TSL 5 BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | MIR30E-201 | ENST00000362104 | 92 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | OR5V1-215 | ENST00000377154 | 1266 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AP002088.1-201 | ENST00000382740 | 395 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | FO393413.1-201 | ENST00000402892 | 195 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AL391839.1-201 | ENST00000417447 | 265 nt | TSL 2 BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
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| CHCHD4 | Q8N4Q1 | LUZP4-201 | ENST00000371920 | 1701 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
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| CHCHD4 | Q8N4Q1 | IL33-201 | ENST00000381434 | 2641 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
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| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC002550.2-201 | ENST00000621246 | 394 nt | BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC008443.7-201 | ENST00000622195 | 246 nt | BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | PROX1-AS1-244 | ENST00000630355 | 599 nt | TSL 5 BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | FAM184A-202 | ENST00000352896 | 3700 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | MCF2-202 | ENST00000370573 | 2583 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | THNSL1-201 | ENST00000376356 | 3691 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC106754.1-201 | ENST00000562632 | 1513 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | MDM2-205 | ENST00000348801 | 798 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | RNA5SP432-201 | ENST00000362480 | 116 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | RNA5SP383-201 | ENST00000362934 | 120 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | Y_RNA.472-201 | ENST00000384322 | 102 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | OR5H8-201 | ENST00000394191 | 1045 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | Z85995.1-201 | ENST00000415547 | 335 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | RPL7P37-201 | ENST00000425095 | 738 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC009158.1-207 | ENST00000432973 | 394 nt | TSL 5 BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | LINC01680-201 | ENST00000434983 | 299 nt | TSL 2 BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
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| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AL714022.1-201 | ENST00000439897 | 151 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | EEF1A1P39-201 | ENST00000440791 | 250 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | BBIP1-206 | ENST00000447005 | 727 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | NANOGNBP1-201 | ENST00000448444 | 480 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | MTND2P24-201 | ENST00000453434 | 806 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AL590639.1-201 | ENST00000456484 | 337 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | RNU7-23P-201 | ENST00000459465 | 62 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |