Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms