Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms