Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms