Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLDN19Q8N6F1 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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