Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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SSX1Q16384 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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SSX1Q16384 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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SSX1Q16384 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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SSX1Q16384 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
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SSX1Q16384 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
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SSX1Q16384 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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SSX1Q16384 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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