Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.4 ms