Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP2

Vmn2r25, MCG130582, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r25W4VSP2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn2r25W4VSP2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms