Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.8 ms