Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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