Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mbd3Q9Z2D8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mbd3Q9Z2D8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mbd3Q9Z2D8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mbd3Q9Z2D8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mbd3Q9Z2D8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mbd3Q9Z2D8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mbd3Q9Z2D8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mbd3Q9Z2D8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Mbd3Q9Z2D8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mbd3Q9Z2D8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mbd3Q9Z2D8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms